Проще говоря, у нас устаревшая версия Веба?

Я ж не знаю, какая у Вас версия веба... А какая она ?

2018.3.13.0
В скором будущем будем менять винты на ССД, так что предстоит переустановка, будем сразу новую ставить..

Михалыч, в ПРО и WEB используется один и тот же движок для обработки данных и расчетов.
Вы говорите, что у Вас WEB c мартовской сборкой движка, а ПРО - с июньской.
Я не исключаю, что даже в ПРО не получится загрузить схему из июньской сборки в мартовскую.

Я хочу предупредить об одном нюансе: чем больше временной разрыв между сборками, тем больше вероятность возможных проблем с конвертацией при обновлении. Не рекомендуем делать большие временные разрывы между обновлениями версий.
В том же 1С нередко приходилось в таких случаях обновляться последовательно через промежуточные релизы.

Учту. Именно 1С как раз так и обновляли ступенчато, шагами по 3-4 релиза.. Будем делать так же.. :) Но я на эту тему еще поспрашиваю, какие там подводные камни, когда все будет готово к переходу..

Михалыч, вообще, должно обновляться и с релизов полугодовой давности корректно без промежуточных обновлений.
Всегда делайте бэкап перед обновлениями и всё будет хорошо.