В 4.х и ниже - будет указан тот полигон, в который ТС въехало первым. В 5.х - показывается вся вложенность.
Чтобы в 4.х сделать разделение - есть два списка геозон. Разделите геозоны по спискам и будет Вам счастье.

А где указывать второй файл КТ и ГЗ? я в окошке списка транспорта во вкладке рейсы тока один выпадающий список для КТ вижу и один для ГЗ. И еще такой вопрос. В редакторе я отключил надписи и убрал отображение узлов полигона. в редакторе кт и гз не отображается а в самой программе непосредственно на карте отображается. как их отключить и в программе а то совсем не видно карты?

SahatoshL, я и имел ввиду вторым списком - список ГЗ. Если он занят, тогда только на 5-ку переходить.

Ладно с этим понятно) а как с надписями быть?)

Разработчик движка еще не успел посмотреть.
К тому же ему понадобятся Ваши данные, чтобы суметь вызвать эти ошибки.