[plex]

plex, чтоб ресурсы не отъедались - или они незначительны?

ресурсы автограф будет отъедать во время запроса данных с сервера, на сам запрос и на просчет открытого рейса..
Хотя вы наверное правы, после формирования отчета АвтоГРАФ останется на последнем ТС и если вы формировали отчет за месяц, то при каждом приеме данных АвтоГРАФ будет его пересчитывать.
Можно выбрать компромисс: отчет формируете за несколько дней+интервал запроса данных с сервера поставить побольше раз в час или 30 минут, отключить все карты, контроль прохождения улиц, то будет работать нормально.
Если вы хотите это все крутить на АвтоГРАФ сервере то конечно его надо отрубать

Добавлено через 2 минуты
А если с планировщиком,
то я бы сделал так: два задания с ограничением по сроку выполнения несколько часов
1 запускать AutoGRAPH.exe
2 через несколько минут запускать ReportsNet.exe с настроенным планировщиком, и он должен закрываться раньше AutoGRAPH.exe