2ГИС по какой-то причине не зарегистрировала на себя тип файла kml.
Самый простой способ:
1. Зайдите в папку АвтоГРАФ
2. Найдите файл с расширением kml (чаще всего это temp.kml)
3. Щелкните по нему правой кнопкой
4. Выберите "Открыть с помощью..."
5. Установите галочку "Использовать выбранную программу для всех файлов такого типа"
6. Выберите 2ГИС или его модуль (чаще всего это "Модуль расширения ДубльГИС V3)
7. Нажмите "ОК"